Não para as duas coisas. Seu dinheiro não sai da conta, ele fica reservado na Caixa Econômica Federal e continua rendendo. Como a garantia faz parte das condições do contrato, você não pode retirá-la enquanto a dívida estiver ativa. O valor que não entrou como garantia continua livre e o reservado é liberado assim que o empréstimo for quitado.